该企业依照外国法律成立且实际管理机构不在中国境内，但在中国境内设立机构、场所的，属于非居民企业，该机构、场所取得来源于中国境内的所得，以及发生在中国境外但与其所设机构、场所有实际联系的所得，应在我国缴纳企业所得税。

（1）来自境内所得额为咨询收入500万元和境内培训收入200万元，合计700万元；

（2）在香港取得的所得在境外且和境内机构、场所无关，不在我国缴纳企业所得税。

综上所述，选项C当选。

甲企业应确认的股权转让所得＝1000－900＝100（万元）。

选项A，企业之间支付的管理费用不得税前扣除；选项B，非银行企业内营业机构之间支付的利息，不得税前扣除，银行企业内营业机构之间支付的利息，可以税前扣除；选项D，烟草企业的烟草广告费和烟草宣传费，不得税前扣除。选项C当选。