下列情形应当缴纳土地增值税的是（　　）。

甲制造有限责任公司系增值税一般纳税人，2025 年发生如下不动产相关业务：

（1）2025 年 3 月通过出让方式取得一块工业用地，签订土地出让合同，合同载明土地出让金不含增值税价款 4000 万元，当月办理不动产权证书，另支付产权登记费 2 万元。该地块用于建造生产厂房，尚未开工建设。

（2）2025 年 7 月30日，将闲置旧厂房对外出租并交付，签订租赁合同，约定租期 2 年，年不含税租金 120 万元，一次性收取两年租金240 万元。旧厂房账面原值 1000 万元。

（3）2025 年 11 月将一处闲置办公楼对外转让，签订不动产转让合同，合同不含税转让价款 6200 万元；该办公楼 2018 年自建，建造成本 2000 万元，转让时账面净值 1200 万元；转让环节可扣除城建税及附加合计 32 万元，取得合规凭证，已按规定预缴土地增值税。

其他相关资料：当地契税税率 3%；印花税财产转移书据税率 0.05%、财产租赁合同 0.1%；土地增值税预缴率 2%。不考虑城镇土地使用税。

甲企业2026年6月对其办公楼进行如下改建或调整：

1.更换办公楼的电梯和部分办公座椅：其中，旧电梯的入账价值16万元，新电梯入账价值30万元；旧桌椅入账价值6万元，新桌椅入账价值8万元。

2.将办公楼空余的房间对外出租，免收租金半年。

该企业咨询下列问题，请你逐一回答：