被收购方应确认股权、资产转让所得或损失，选项A错误；收购方取得股权或资产的计税基础应以公允价值为基础确定，选项C、D错误。

选项B，被合并企业的亏损不得在合并企业结转弥补；选项C、D，合并企业应按公允价值确定接受被合并企业各项资产和负债的计税基础。选项A当选。

此题业务符合特殊性税务处理的条件。对于被收购企业的股东取得收购企业股权的计税基础，以被收购股权的原有计税基础确定。股权支付的部分不确认所得和损失；对于非股权支付的部分，要按照规定确认所得和损失，依法计算缴纳企业所得税。甲企业转让股权的应纳税所得额＝4500×（14－12）×7560÷（7560＋55440）＝1080（万元）。甲企业转让股权应缴纳企业所得税＝1080×25%＝270（万元）。

该股权收购中乙公司股权支付金额占交易支付总额的比例＝6480÷（6480＋720）×100%＝90%，非股权支付比例＝1－90%＝10%。

（1）非股权支付对应的资产转让所得或损失＝（被转让资产的公允价值－被转让资产的计税基础）×（非股权支付金额÷被转让资产的公允价值）＝（9－7）×1000×80%×10%＝160（万元）。

（2）甲公司股东取得乙公司股权的计税基础＝7×1000×80%×90%＝5040（万元）。

（3）乙公司取得甲公司股权的计税基础＝720＋1000×80%×90%×7＝5760（万元）。

综上所述，选项A、C、D当选。