关联企业利息费用的扣除要判断总量的合理性和利率的合理性；第一个合理性判断：从资本结构角度判别借款总量的合理性，即通过债资比例来判别关联借款总量是否超标（接受关联方债权性投资和权益性投资的比例，金融企业5：1，其他企业2：1）。该企业用来计算准许扣除的利息支出的合理借款总量＝3500×2＝7000（万元）。第二个合理性判断：非金融企业向非金融企业借款的利息支出，不超过按照金融企业同期同类贷款利率计算的利息。合理的利率水平的利息费用＝7000×8%＝560（万元）。

选项A、B、E，属于符合条件的股息、红利所得，免税；选项C，国债利息收入属于免税收入，转让所得要缴纳企业所得税；选项D，公司债券利息收入没有免税优惠。

选项C，年金基金投资运营收益分配计入个人账户时，个人暂不缴纳个人所得税。

（1）多缴税款可以退还。

纳税人超过应纳税额缴纳的税款，纳税人自结算缴纳税款之日起3年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还。甲公司2022年的企业所得税是2023年5月20日缴纳的，截止到2024年6月2日未超过3年，因此，可以申请退还多缴税款。

（2）不能直接提起行政诉讼。此项行为属于征税行为，申请人对税务机关作出的征税行为不服的属于必经复议的情形，应当先向行政复议机关申请行政复议；对行政复议决定不服的，可以向人民法院提起行政诉讼。

（3）复议机关为A市税务局的上级税务机关。

应从2024年6月11日起60日内提出申请。

（4）复议机关应自受理之日60日内作出复议决定。但是法律规定的行政复议期限少于60日的除外。情况复杂，不能在规定期限内作出行政复议决定的，经行政复议机构的负责人批准，可以适当延长，并书面告知当事人；但是延长期限最多不得超过30日。