（1）职工福利费实际发生35万元，扣除限额＝200×14%＝28（万元），应调增所得额7万元；

（2）工会经费实际发生3.5万元，扣除限额＝200×2%＝4（万元），无须纳税调整；

（3）职工教育经费：软件企业发生的职工培训费用4万元可以全额扣除；职工教育经费实际发生额＝8－4＝4（万元），职工教育经费扣除限额＝200×8%＝16（万元），无须纳税调整；

（4）补充养老保险实际发生12万元，扣除限额＝200×5%＝10（万元），应调增所得额＝12-10＝2（万元）；

（5）补充医疗保险实际发生8万元，扣除限额＝200×5%＝10（万元），无须纳税调整。

综上所述，应调增所得额为9万元，选项B当选。

采取商业折扣方式销售货物的，按扣除商业折扣后的金额确定销售商品收入金额，确认的销售收入＝40－3＝37（万元）。

（1）可以据实在税前扣除的保险费有：

①企业为职工缴纳标准内的五险一金

②特殊工种人身安全保险及符合规定的可扣除的其他商业保险

③企业参加的财产保险

④企业职工因公出差乘坐交通工具发生的人身意外保险费支出

⑤企业参加雇主责任险、公众责任险等责任保险的保险费支出

（2）可以限额在税前扣除的保险费有：

补充养老和补充医疗保险：分别不超过工资总额 5% 的部分准予扣除

（3）不得在税前扣除的保险费有：

企业为投资者、职工或职工家庭支付的商业保险

综上所述，选项B、C、E当选。