根据规定，免征蔬菜流通环节增值税。零售图书免征增值税。销项税额＝13080÷（1＋9%）×9%＋96000÷（1＋13%）×13%＋40000÷（1＋9%）×9%＝15427（元）。

该企业进口设备应缴纳的关税＝（60＋10＋3＋5）×20%＝15.6（万元）。

动物诊疗机构销售动物食品和用品，提供动物清洁、美容、代理看护等服务，应按照现行规定缴纳增值税。动物诊疗机构提供的动物疾病预防、诊断、治疗和动物绝育手术等动物诊疗服务，免征增值税。该宠物医院当月销项税额＝22×13%＋（10＋4）×6%＝3.7（万元）。

选项A，纳税人（卷烟批发企业除外）总机构和分支机构不在同一县（市）的，应分别向各自机构所在地的主管税务机关申报纳税。选项C，委托加工的应税消费品，除受托方为个人外，由受托方向机构所在地或者居住地的主管税务机关解缴消费税税款；委托个人加工的应税消费品，由委托方向其机构所在地或者居住地主管税务机关申报纳税。选项D，卷烟批发企业的总机构与分支机构不在同一地区的，由总机构申报纳税。