本题考查企业所得税税收优惠。

企业综合利用资源，生产符合国家产业政策规定的产品所取得的收入，可以在计算应纳税所得额时，减按90%计入收入总额。

依据题干数据，该企业可以在计算应纳税所得额时减计的收入=400×（1-90%）=40（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查企业所得税的税前扣除。

2025年12月31日之前，对化妆品制造或销售、医药制造和饮料制造（不含酒类制造）企业发生的广告费和业务宣传费支出，不超过当年销售（营业）收入30%的部分，准予扣除；超过部分，准予在以后纳税年度结转扣除。

依据题干数据，广告费扣除限额=6 000×30%=1 800（万元）＞实际发生的1 000万元，可据实扣除。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查企业所得税的税前扣除。

企业发生的与生产经营活动有关的业务招待费支出，按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的5‰。

依据题干数据，业务招待费扣除限额1=100×60%=60（万元），扣除限额2=6 000×5‰=30（万元），则业务招待费扣除限额为30万元＜实际发生的100万元，该企业可在税前扣除的业务招待费为30万元。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查企业所得税税收优惠。

企业购置并实际使用《环境保护专用设备企业所得税优惠目录》《节能节水专用设备企业所得税优惠目录》《安全生产专用设备企业所得税优惠目录》规定的环境保护、节能节水、安全生产等专用设备的，该专用设备投资额的10%可以从企业当年的应纳税额中抵免；当年不足抵免的，可以在以后5个纳税年度结转抵免。

依据题干数据，该企业本年度可以抵免应纳税额=1 000×10%=100（万元）。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查企业所得税税收优惠。

对企业出资给非营利性科学技术研究开发机构、高等学校和政府性自然科学基金用于基础研究的支出，在计算应纳税所得额时可按实际发生额在税前扣除，并可按100%在税前加计扣除。

因此，本题正确答案为选项A。