选项A、D、E，有限责任公司设立时的股东为设立公司从事的民事活动，其法律后果由公司承受。

选项B，本题中涉及的是合同的违约责任，而非侵权责任。

选项A，甲利用其关联公司进行虚假交易将其出资转出，构成抽逃出资，公司成立后，股东或者出资人不得抽逃出资。违反规定的，股东或者出资人应当返还。

选项B，增加注册资本属于股东会的职权。

选项C，董事、高级管理人员执行公司职务时违反法律、行政法规或者公司章程的规定，给公司造成损失的，有限责任公司的股东可以书面请求监事会向人民法院提起诉讼。

选项D，根据《企业破产法》规定，企业破产原因是债务人不能清偿到期债务，并且资产不足以清偿全部债务或者明显缺乏清偿能力。本题中，无法判断明月公司已经具备了破产原因。此外，破产申请人包括债务人、债权人、依法对债务人负有清算责任的人以及国务院金融监督管理机构。原则上股东无破产申请权。

选项E，董事、监事、高级管理人员执行公司职务时违反法律、行政法规或者公司章程规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。

选项A、E，修改公司章程、公司增资或者减资，应当经代表2/3以上表决权的股东通过。

选项B，有限责任公司股东按照实缴的出资比例分配利润，但是，全体股东约定不按照出资比例分配利润的除外。

选项C，股东向股东以外的人转让股权的，应当将股权转让的数量、价格、支付方式和期限等事项书面通知其他股东，其他股东在同等条件下有优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。

选项D，由股东按照出资比例行使表决权，但公司章程另有规定的除外。