本题考查增值税的计税依据。

【选项D错误】纳税人发生应税行为，如果价款和折扣额在同一张发票上分别注明的，以折扣后的价款为销售额征收增值税；如果将折扣额另开发票，不论其在财务上如何处理，均不得从销售额中减除折扣额。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查增值税和消费税的征收范围。

【选项A错误】批发环节销售的啤酒征收增值税不征收消费税。

【选项B正确】生产环节销售的实木地板应同时征收增值税和消费税。

【选项C错误】普通护肤品不属于消费税的征收范围。

【选项D错误】进口环节取得外国政府捐赠的小汽车免征增值税。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税的征税范围。

转让建筑物有限产权或者永久使用权的【选项C】，转让在建的建筑物或者构筑物所有权的【选项D】，以及在转让建筑物或者构筑物时一并转让其所占土地使用权的【选项E】，按照销售不动产缴纳增值税。

【选项A错误】纳税人通过省级土地行政主管部门设立的交易平台转让补充耕地指标，按照销售无形资产缴纳增值税，税率为6%。

【选项B错误】转让特许经营权属于销售无形资产。

因此，本题正确答案为选项CDE。

本题考查增值税的计税依据。

纳税人发生应税行为，如果价款和折扣额在同一张发票上分别注明的，以折扣后的价款为销售额征收增值税；如果将折扣额另开发票，不论其在财务上如何处理，均不得从销售额中减除折扣额。

依据题干数据，甲公司当月该笔业务应缴纳增值税=（90 000-9 000）×13%=税10 530（元）。

因此，本题正确答案为选项B。