本题考查增值税应纳税额的计算。

一般纳税人销售自产的下列货物，可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税：

①县级及县级以下小型水力发电单位生产的电力。小型水力发电单位，是指各类投资主体建设的装机容量为5万千瓦以下（含5万千瓦）的小型水力发电单位。

②建筑用和生产建筑材料所用的砂、土、石料。

③以自己采掘的砂、土、石料或其他矿物连续生产的砖、瓦、石灰（不含黏土实心砖、瓦）。

④用微生物、微生物代谢产物、动物毒素、人或动物的血液或组织制成的生物制品。【选项E】

⑤自来水。【选项B】

⑥商品混凝土（仅限于以水泥为原料生产的水泥混凝土）。【选项D】

因此，本题正确答案为选项BDE。

本题考查增值税的纳税人和扣缴义务人。

【选项A错误】单位以承包、承租、挂靠方式经营的，承包人、承租人、挂靠人以发包人、出租人、被挂靠人名义对外经营并由发包人承担相关法律责任的，以该发包人为纳税人；否则，以承包人为纳税人。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查增值税的征税范围。

转让建筑物有限产权或者永久使用权的【选项C】，转让在建的建筑物或者构筑物所有权的【选项D】，以及在转让建筑物或者构筑物时一并转让其所占土地使用权的【选项E】，按照销售不动产缴纳增值税。

【选项A错误】纳税人通过省级土地行政主管部门设立的交易平台转让补充耕地指标，按照销售无形资产缴纳增值税，税率为6%。

【选项B错误】转让特许经营权属于销售无形资产。

因此，本题正确答案为选项CDE。

本题考查增值税应纳税额的计算。

一般纳税人选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。

因此，本题正确答案为选项C。