本题考查增值税应纳税额的计算。

小规模纳税人销售自己使用过的固定资产和旧货（二手车除外），按下列公式确定销售额和应纳税额：销售额=含税销售额÷（1+3%），应纳税额=销售额×2%。

依据题干数据，应纳增值税=200 000÷（1+3%）×2%=3 883.50（元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查增值税的计税依据。

纳税人为销售货物而出租出借包装物收取的押金，单独记账核算的，不并入销售额征税。但对因逾期（以1年为期限）未收回包装物不再退还的押金，应按所包装货物的适用税率征收增值税。

依据题干数据，甲厂2024年5月销售食品应纳税额=113×13%=14.69（万元）。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查增值税的税率与征收率。

纳税人销售交通运输【选项B、D】、邮政【选项A】、基础电信【选项E】、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，税率为9%。

【选项C错误】货物运输代理服务属于现代服务，税率为6%。

因此，本题正确答案为选项ABDE。

本题考查增值税的纳税人和扣缴义务人。

【选项A错误】单位以承包、承租、挂靠方式经营的，承包人、承租人、挂靠人以发包人、出租人、被挂靠人名义对外经营并由发包人承担相关法律责任的，以该发包人为纳税人；否则，以承包人为纳税人。

因此，本题正确答案为选项A。