选项A，再销售价格法通常适用于再销售者未对商品进行改变外形、性能、结构或变更商标等实质性增值加工的简单加工或单纯购销业务；选项C，成本加成法通常适用于有形资产的购销、转让和使用，劳务提供或资金融通的关联交易；选项D，交易净利润法一般适用于不拥有重大价值无形资产企业的有形资产使用权或者所有权的转让和受让、无形资产使用权受让以及劳务交易等关联交易。综上所述，选项B当选。

企业与关联方签署成本分摊协议，发生特殊情形会导致其自行分配的成本不得于税前扣除：

（1）不具有合理商业目的和经济实质；（选项C）

（2）自签署成本分摊协议之日起经营期限少于20年；

（3）没有遵循成本与收益配比原则；（选项B）

（4）未按照有关规定备案或准备有关成本分摊协议的同期资料；（选项E）

（5）不符合独立交易原则。（选项A）

企业与其关联方签署成本分摊协议，有下列情形之一的，其自行分摊的成本不得税前扣除：

（1）不具有合理商业目的和经济实质；（选项B正确）

（2）不符合独立交易原则；（选项A正确）

（3）没有遵循成本与收益配比原则；

（4）未按有关规定备案或准备、保存和提供有关成本分摊协议的同期资料；

（5）自签署成本分摊协议之日起经营期限少于20年。（选项E正确）