选项A，再销售价格法通常适用于再销售者未对商品进行改变外形、性能、结构或变更商标等实质性增值加工的简单加工或单纯购销业务；选项C，成本加成法通常适用于有形资产的购销、转让和使用，劳务提供或资金融通的关联交易；选项D，交易净利润法一般适用于不拥有重大价值无形资产企业的有形资产使用权或者所有权的转让和受让、无形资产使用权受让以及劳务交易等关联交易。综上所述，选项B当选。

企业与关联方签署成本分摊协议，发生特殊情形会导致其自行分配的成本不得于税前扣除：

（1）不具有合理商业目的和经济实质；（选项C）

（2）自签署成本分摊协议之日起经营期限少于20年；

（3）没有遵循成本与收益配比原则；（选项B）

（4）未按照有关规定备案或准备有关成本分摊协议的同期资料；（选项E）

（5）不符合独立交易原则。（选项A）

年度关联交易金额符合下列条件之一的企业，应当准备本地文档：

（1）有形资产所有权转让金额（来料加工业务按照年度进出口报关价格计算）超过2亿元；

（2）金融资产转让金额超过1亿元；（选项C正确）

（3）无形资产所有权转让金额超过1亿元；（选项B正确）

（4）其他关联交易金额合计超过4000万元。（选项D正确）

因此选项B、C、D当选。