本题考查契税。

【选项A、D错误】土地使用权出让、出售，房屋买卖，为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格，包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。

【选项B正确】土地使用权赠与、房屋赠与以及其他没有价格的转移土地、房屋权属行为，为税务机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格依法核定的价格

【选项C错误】土地使用权互换、房屋互换，为所互换的土地使用权、房屋价格的差额。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查耕地占用税。

农村居民在规定用地标准以内占用耕地新建自用住宅，按照当地适用税额减半征收耕地占用税；其中农村居民经批准搬迁，新建自用住宅占用耕地不超过原宅基地面积的部分，免征耕地占用税。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查土地增值税。

该公司转让房产中获得的增值额=12 000-7 000=5 000（万元）。

增值率=5 000÷7 000≈71.43%

根据土地增值税四级超率累进税率（见下表），确定税率为40%，速算扣除系数为5%。

则应纳土地增值税税额=5 000×40%-7 000×5%=1 650（万元）。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查土地增值税。

【选项A错误】纳税人建造普通标准住宅出售，增值额未超过扣除项目金额20%的，免征土地增值税；增值额超过扣除项目金额之和20%的，应就其全部增值额按规定计税。普通标准住宅是指按所在地一般民用住宅标准建造的居住用住宅。高级公寓、别墅、度假村等不属于普通标准住宅。普通标准住宅与其他住宅的具体划分界限由各省、自治区、直辖市人民政府规定。

【选项C错误】企业按照公司法有关规定整体改制，包括非公司制企业改制为有限责任公司或股份有限公司，有限责任公司变更为股份有限公司，股份有限公司变更为有限责任公司，对改制前的企业将国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物（以下称房地产）转移、变更到改制后的企业，暂不征收土地增值税。

因此，本题正确答案为选项BDE。