本题考查契税。

契税的征税对象是发生土地使用权和房屋所有权权属转移的土地和房屋。具体征税范围包括：

①土地使用权出让。【选项D】

②土地使用权转让，包括出售、赠与和互换，但不包括农村集体土地承包经营权和土地经营权的转移。

③房屋买卖赠与、互换。【选项A、C】

【选项B错误】房屋出租没有涉及不动产的产权变化，不属于契税征税范围。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查契税。

土地使用权出让、出售，房屋买卖，计税依据为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格，包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。契税应纳税额的计算公式为：应纳税额=计税依据×税率。

依据题干数据，该公司应缴纳的契税=3 500×3%=105（万元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查土地增值税。

土地增值税实行的是四级超率累进税率。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查土地增值税。

【选项D错误】土地增值税对以继承、赠与等方式无偿转让的房地产，不予征税。

【选项E错误】如果投资联营的企业从事房地产开发，或者房地产开发企业以其建造的商品房进行投资联营的不能免征土地增值税。

因此，本题正确答案为选项ABC。