本题考查契税。

【选项A、D错误】土地使用权出让、出售，房屋买卖，为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格，包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款。

【选项B正确】土地使用权赠与、房屋赠与以及其他没有价格的转移土地、房屋权属行为，为税务机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格依法核定的价格

【选项C错误】土地使用权互换、房屋互换，为所互换的土地使用权、房屋价格的差额。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查土地增值税。

【选项B错误】纳税人建造普通标准住宅出售，增值额未超过扣除项目金额之和20%的，免征土地增值税；增值额超过扣除项目金额之和20%的，应就其全部增值额按规定计税。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查土地增值税。

【选项D错误】土地增值税对以继承、赠与等方式无偿转让的房地产，不予征税。

【选项E错误】如果投资联营的企业从事房地产开发，或者房地产开发企业以其建造的商品房进行投资联营的不能免征土地增值税。

因此，本题正确答案为选项ABC。

本题考查土地增值税。

①土地增值税应税收入=10 000（万元）。

②取得土地使用权所支付的金额=1 000（万元）；

   房地产开发成本=3 000（万元）；

   财务费用中的利息支出，凡能够按转让房地产项目计算分摊并提供金融机构证明的，允许据实扣除，但最高不能超过按商业银行同类同期贷款利率计算的金额。其他房地产开发费用，在按照“取得土地使用权所支付的金额”与“房地产开发成本”金额之和的5%以内计算扣除。所以，房地产开发费用=500+（1 000+3 000）×5%=700（万元）；

   与转让房地产有关的税金=555（万元）；

   对从事房地产开发的纳税人可按“取得土地使用权所支付的金额”与“房地产开发成本”规定计算的金额之和，加计20%的扣除。所以，财政部规定的其他扣除项目=（1 000+3 000）×20%=800（万元）

   扣除项目金额=1000+3000+700+555+800=6055（万元）

③该公司转让房产中获得的增值额=10000-6055=3945（万元）

④增值率=3945÷6055×100%=65.15%。

⑤

确定土地增值税税率为40%，速算扣除系数为5%，应纳土地增值税税额=3945×40%-6055×5%=1275.25（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。