本题考查增值税应纳税额的计算。

纳税人在购进农产品时，应按照农产品抵扣的一般规定，按照9%计算抵扣进项税额。在领用农产品环节，如果农产品用于生产或者委托加工13%税率货物，则再加计1%进项税额。

依据题干数据，该企业7月应确认的进项税额=50 000×10%+2 000×9%=5 180（元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税的计税依据。

纳税人发生应税行为，如果价款和折扣额在同一张发票上分别注明的，以折扣后的价款为销售额征收增值税；如果将折扣额另开发票，不论其在财务上如何处理，均不得从销售额中减除折扣额。

依据题干数据，甲公司当月该笔业务应缴纳增值税=（90 000-9 000）×13%=税10 530（元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税的计税依据。

【选项C错误】金融商品转让，按照卖出价扣除买入价后的余额为销售额。

【选项D错误】经纪代理服务，向委托方收取的政府性基金或者行政事业性收费，不得开具增值税专用发票。

因此，本题正确答案为选项ABE。

本题考查增值税的计税依据。

增值税的计税依据即为销售额，销售额为纳税人发生应税销售行为取得的全部价款和价外费用，但是不包括收取的销项税额。上述价外费用，包括价外向购买方收取的手续费【选项B】、补贴、基金、集资费、返还利润、奖励费、违约金、滞纳金、延期付款利息、赔偿金、代收款项、代垫款项、包装费【选项C】、包装物租金、储备费【选项D】、优质费【选项E】、运输装卸费以及其他各种性质的价外收费。

因此，本题正确答案为选项BCDE。