本题考查增值税的纳税人和扣缴义务人。

在中华人民共和国境内销售服务、无形资产、不动产是指：

①服务（租赁不动产除外）或者无形资产（自然资源使用权除外）的销售方或者购买方在境内；【选项C】

②所销售或者租赁的不动产在境内；【选项D】

③所销售自然资源使用权的自然资源在境内；【选项A】

④财政部和国家税务总局规定的其他情形。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税的征税范围。

纳税人通过省级土地行政主管部门设立的交易平台转让补充耕地指标，按照销售无形资产缴纳增值税，税率为6%。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查增值税的税率与征收率。

【选项A错误】纳税人销售或进口电子出版物，税率为9%。

【选项B错误】纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，税率为9%。

【选项E错误】提供有形动产租赁服务，税率为13%。

因此，本题正确答案为选项CD。

本题考查增值税的计税依据。

【选项A错误】航空运输企业的销售额，不包括代收的机场建设费和代售其他航空运输企业客票而代收转付的价款。

因此，本题正确答案为选项A。