企业的免税收入包括：

（1）国债利息收入；

（2）符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益；

（3）在中国境内设立机构、场所的非居民企业从居民企业取得与该机构、场所有实际联系的股息、红利等权益性投资收益；

（4）通过沪港通、深港通投资持股满12个月取得的股息红利；（选项E正确）

（5）投资创新企业CDR取得的符合条件的股息红利；（选项D正确）

（6）符合条件的永续债利息收入；（选项A正确）

（7）非营利性科研机构、高等学校接收企业、个人和其他组织机构基础研究资金收入；（选项B正确）

（8）符合条件的非营利组织的免税收入。

因此选项A、B、D、E当选。

下列活动不适用税前加计扣除政策：

（1）企业产品（服务）的常规性升级；（选项D）

（2）对某项科研成果的直接应用，如直接采用公开的新工艺、材料、装置、产品、服务或知识等；

（3）企业在商品化后为顾客提供的技术支持活动；

（4）对现存产品、服务、技术、材料或工艺流程进行的重复或简单改变；

（5）市场调查研究、效率调查或管理研究；

（6）作为工业（服务）流程环节或常规的质量控制、测试分析、维修维护；

（7）社会科学、艺术或人文学方面的研究。