（1）经过复议的案件，复议机关维持原行政行为的，复议机关和作出原行政行为的机关为共同被告，故县税务局和市税务局是共同被告。所以选项A、B错误。

（2）行政机关不予退还税款的行为属于征税行为，行政相对人应当先向行政复议机关申请行政复议，对复议决定不服的，才可以向人民法院提起行政诉讼。所以选项C错误。

（3）人民法院应当在审查原行政行为合法性的同时，一并审查复议决定的合法性。人民法院对原行政行为作出判决的同时，应当对复议决定一并作出相应判决。所以选项D正确。

（4）人民法院审理行政案件既审查事实问题也审查法律问题，并且可以适用最高人民法院的司法解释。所以选项E正确。

人民法院审理行政案件，不适用调解。但是，行政赔偿、补偿以及行政机关行使法律、法规规定的自由裁量权的案件可以调解。

选项A，行政行为明显不当，人民法院应当作出撤销判决。

选项B、C、D，《行政诉讼法》第75条规定，行政行为有实施主体不具有行政主体资格或者没有依据等重大且明显违法情形，原告申请确认行政行为无效的，人民法院判决确认无效。属于《行政诉讼法》第75条规定的“重大且明显违法”：

（1）行政行为实施主体不具有行政主体资格；

（2）减损权利或者增加义务的行政行为没有法律规范依据；

（3）行政行为的内容客观上不可能实施。