选项A，农田排灌沟渠属于农田水利用地，不属于非农业建设，不征收耕地占用税；

选项B，属于占用耕地建设社会福利机构，免征耕地占用税；

选项C，按照当地适用税额缴纳耕地占用税；选项D，减按2元/平方米征收耕地占用税。

非居民企业取得下列所得免征企业所得税：

（1）外国政府向中国政府提供贷款取得的利息所得；

（2）国际金融组织向中国政府和居民企业提供优惠贷款取得的利息所得；（选项D）

（3）经国务院批准的其他所得。

选项B，境外机构投资者转让境内上市流通股票免征企业所得税；

选项E，境外机构投资者投资境内债券市场取得利息收入，免征企业所得税。

直接从事研发活动人员的工资薪金等加计扣除；用于研发活动的仪器折旧可以加计扣除，但是研发大楼不属于研发用仪器设备。选项E，不属于研发活动相关直接费用。选项A、B、E不当选。

选项B，个人捐赠住房作为公共租赁住房，符合税收法律法规规定的，对其公益性捐赠支出未超过其申报的应纳税所得额30%的部分，准予从其应纳税所得额中扣除。