选项C，逾期开发缴纳的土地闲置费不得在计算土地增值税时扣除，故不能作为加计扣除的依据。

选项C，农副产品加工厂占地照章征收城镇土地使用税。

下列情形，暂予免征环境保护税：

（1）农业生产（不包括规模化养殖）排放应税污染物的；

（2）机动车、铁路机车、非道路移动机械、船舶和航空器等流动污染源排放应税污染物的；（选项B）

（3）依法设立的城乡污水集中处理、生活垃圾集中处理场所排放相应应税污染物，不超过国家和地方规定的排放标准的；（选项D）

（4）纳税人综合利用的固体废物，符合国家和地方环境保护标准的；（选项C）

（5）国务院批准免税的其他情形。选项E，纳税人排放应税大气污染物或者水污染物的浓度值低于国家和地方规定的污染物排放标准百分之三十的，减按百分之七十五征收环境保护税。

综上所述，选项B、C、D属于免征环境保护税的情形，当选。选项A、E不属于免征环境保护税的情形，不当选。