直接材料耗用量差异形成的原因包括产品设计结构、原料质量、工人的技术熟练程度、废品率的高低等。直接材料运输方式的不同是材料价格差异形成的原因。选项B当选。

修正的MM理论认为，有负债企业的价值等于同一风险等级中某一无负债企业价值加上赋税节余的价值，选项A不当选。

股权筹资的缺点是资本成本较高、控制权变更可能影响企业长期稳定发展、信息沟通与披露成本较大。本题表述正确。

双重股权结构的优点:同股不同权制度能避免企业内部股权纷争，保障企业创始人或管理层对企业的控制权(选项C不当选)，防止公司被恶意收购(选项A不当选);提高企业运行效率，有利于企业的长期发展。 双重股权结构的缺点:容易导致管理中独裁行为的发生；控股股东为自己谋利而损害非控股股东的利益，不利于非控股股东利益的保障（选项B当选）；可能加剧实际经营者的道德风险和逆向选择(选项D不当选)。