选项D，房地产开发企业转让其开发的商品房应缴纳的土地增值税，应借记“税金及附加”科目，贷记“应交税费——应交土地增值税”科目。

选项B，不在“税金及附加”中核算，应在“应交税费”中核算；选项E，契税计入写字楼的入账价值中。在“税金及附加”中核算的包括：经营活动发生的消费税、城市维护建设税、资源税、教育费附加及房产税、城镇土地使用税、车船税、印花税等相关税费。

选项B、C、D，属于“应交税费——应交增值税”明细科目借方专栏。

企业销售的在“固定资产”等科目核算的土地使用权及地上建筑物，计算应缴纳的城市维护建设税：

借：固定资产清理

　贷：应交税费——应交城市维护建设税

综上所述，选项A当选。