“多证合一”改革之外的其他组织，如事业单位（选项B）、社会组织（选项D）、境外非政府组织等，应当依法和税务总局规定向税务机关办理税务登记。

在“多证合一”改革之内的，领取加载统一社会信用代码证件的企业（选项A）、农民专业合作社（选项E）、个体工商户（选项C）及其他组织无须单独到税务机关办理该事项，其领取的证件作为税务登记证件使用。

综上所述，选项B、D当选。选项A、C、E不当选。

选项A，任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：（1）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；（2）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；（3）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。

增值税专用发票的作废，符合作废条件是指同时具有下列情形：

（1）收到退回的发票联、抵扣联且时间未超过销售方开票的当月；（选项A）

（2）销售方未抄税并且未记账；（选项B）

（3）购买方未认证，或者认证结果为“纳税人识别号认证不符”、“增值税专用发票代码、号码认证不符”。（选项E）

综上所述，选项A、B、E属于增值税专用发票的作废条件，当选。选项C、D不属于增值税专用发票的作废条件，不当选。

纳税人在首次申请领用发票时，办理的主要涉税事项包括发票票种核定（选项A）、增值税专用发票（增值税税控系统）最高开票限额审批（选项B）、增值税税控系统专用设备初始发行（选项C）、发票领用（选项D）等涉税事项。选项E，属于后续申领发票办理的涉税事项。