“多证合一”改革之外的其他组织，如事业单位（选项B）、社会组织（选项D）、境外非政府组织等，应当依法和税务总局规定向税务机关办理税务登记。

在“多证合一”改革之内的，领取加载统一社会信用代码证件的企业（选项A）、农民专业合作社（选项E）、个体工商户（选项C）及其他组织无须单独到税务机关办理该事项，其领取的证件作为税务登记证件使用。

综上所述，选项B、D当选。选项A、C、E不当选。

符合市场监管部门简易注销条件，且符合以下条件的纳税人，免予到税务部门单独办理清税证明，可直接向市场监管部门申请简易注销登记。

（1）未办理过涉税事宜；

（2）办理过涉税事宜但未领用发票（含代开发票）、无欠税（滞纳金）及罚款且没有其他未办结涉税事项；

（3）查询时已办结缴销发票、结清应纳税款等清税手续；

（4）无欠缴社会保险费、滞纳金、罚款。

选项B，不符合规定的发票，不得作为财务报销凭证，任何单位和个人有权拒收；

选项C，任何单位和个人均不得以其他凭证代替发票使用；

选项D，纳税人同时丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联和抵扣联，可凭加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证。

选项A，开具发票的单位和个人应当按照国家有关规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联，应当保存5年。