本题考查政府预算模式。

零基预算的缺点在于不是所有的预算收支项目都能采用零基预算，有些收支在一定时期内具有刚性，如公债还本付息支出、公务员的工资福利支出、跨年度的连续性项目等。另外，每年对所有的收支都进行审核是一项需要消耗大量人力、物力和财力的工作，并且会引起不同利益集团利益分配的博弈，导致行政成本增加。

【选项A错误】国家以资产所有者身份取得的收入，以及国家特定用于投资方面的某些收入和直接用于国家投资方面的支出，列入资本预算。

【选项B错误】基数法编制预算的缺点包括：①收支基数的科学性、合理性难以界定。②在预算编制中，年度国家政策变化、财力增加额及支出实际需要量等因素的分析，以及增减变化率的确定，主要依靠预算编制人员主观判断，主观随意性较大，缺乏准确的科学依据。

【选项D错误】单式预算的缺点是不能反映各项财政收支的经济性质，不利于监督和管理，也不利于体现政府在不同领域活动的性质、特点。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查政府预算模式。

国有资本经营预算是对国有资本收益做出支出安排的收支预算，即是对政府在一个财政年度内国有资产经营性收支活动进行价值管理和分配。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查印花税。

【选项A正确】对个人出租、承租住房签订的租赁合同，免征印花税。

【选项B正确】对农民专业合作社与本社成员签订的农业产品和农业生产资料购销合同，免征印花税。

【选项C正确】非营利性医疗卫生机构采购药品或者卫生材料书立的买卖合同，免征印花税。

【选项D错误】企业销售或购买住房应按照产权转移书据缴纳印花税。

【选项E正确】财产所有权人将财产赠与政府、学校、社会福利机构、慈善组织书立的产权转移书据免征印花税。

因此，本题正确答案为选项ABCE。

本题考查教育、科学技术和医疗卫生支出。

完善科技投入机制：

①建立多元化、多渠道的科技投入体系，大幅度增加科技投入，全社会研究开发投入占GDP的比例要提高；【选项A】

②确保财政科技投入的稳定增长，预算及其执行中超收的分配，都要体现法定增长的要求，财政科技投入的增幅要明显高于财政经常性收入的增幅；【选项B】

③财政科技投入的重点是支持基础研究、社会公益性研究和前沿技术研究；【选项C】

④发挥财政资金对激励企业自主创新的引导作用，创新财政科技投入的管理机制。【选项E】

【选项D错误】加大对企业自主创新投入的所得税税前抵扣的力度是税收激励的具体措施之一。

因此，本题正确答案为选项ABCE。