选项D，纳税人违反国家有关法律、法规规定，被有关部门处以的罚款、罚金和被没收的财物，不得税前扣除。

除机动车销售统一发票（选项E）、农产品销售发票、通行费发票、收费公路通行费增值税电子普通发票，以及国内旅客运输服务的增值税电子普通发票、航空运输电子客票行程单（选项B）、电子发票（铁路电子客票）（选项A）和公路、水路等其他客票、农产品收购发票，以及符合条件的由交易所开具的标准黄金交易的普通发票等外，增值税普通发票不能作为抵扣增值税进项税额的凭证。