本题考查资源税。

对疏干排水中回收利用的部分和水源热泵取用水，从低确定税额。

【选项A错误】采油（气）排水经分离净化后在封闭管道回注的，免征水资源税。

【选项B错误】抽水蓄能发电取用水，免征水资源税。

【选项D错误】受县级以上人民政府及有关部门委托进行国土绿化、地下水回灌、河湖生态补水等生态取用水，免征水资源税。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查税务行政复议。

【选项A错误】合伙企业申请行政复议的，应当以核准登记的企业为申请人，由执行合伙事务的合伙人代表该企业参加行政复议；其他合伙组织申请行政复议的，由合伙人共同申请行政复议。

【选项C错误】行政复议期间，行政复议机关认为申请人以外的公民、法人或者其他组织与被审查的具体行政行为有利害关系的，可以通知其作为第三人参加行政复议。

【选项D错误】股份制企业的股东大会、股东代表大会、董事会认为税务具体行政行为侵犯企业合法权益的，可以以企业名义申请行政复议。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税应纳税额的计算。

除《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第二十九条（即年应税销售额超过小规模纳税人标准的其他个人按小规模纳税人纳税的；非企业性单位、不经常发生应税行为的企业选择按小规模纳税人纳税的）规定外，纳税人销售额超过小规模纳税人标准，应当办理一般纳税人资格登记而未办理的，应按销售额和增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发票。餐饮服务属于生活服务，适用增值税税率6%。

依据题干数据，该纳税人应缴纳的增值税＝109.18÷（1＋6%）×6%＝6.18（万元）。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查纳税检查的概念、必要性及范围。

纳税检查的客体是纳税人【选项E】，同时包括代扣代缴义务人【选项C】、代收代缴义务人【选项D】、纳税担保人等。

因此，本题正确答案为选项CDE。