选项A错误，生产用设备的折旧应登记制造费用，不影响损益。

选项C错误，即征即退的增值税应贷方登记其他收益科目。

选项D错误，收到的洪灾弥补损失，属于与过去相关的收益类政府补助，应直接冲减营业外支出。

预期可获得的第三方补偿不能冲减预计负债，选项A错误；

存在标的资产的亏损合同预计亏损大于标的资产减值损失的部分应计入主营业务成本，选项B错误；

与产品质量保证相关的负债应按照最佳估计数借记“主营业务成本”，贷记“预计负债”，选项C错误；

待执行合同变成亏损合同，在符合条件的情况下需要确认预计负债，该预计负债的金额应反映履行该合同和未履行合同而发生的处罚两者较低者确认，选项E错误。

A原材料的减值计算如下：

有合同部分：

W产成品的可变现净值＝1 120－65×70％＝1 074.5（万元）

W产成品的成本＝1 200×70％＋300×70％＝1 050（万元）

有合同部分未发生减值

无合同部分：

W产成品的可变现净值＝1 350×30％－65×30％＝385.5（万元）

W产成品的成本＝1 200×30％＋300×30％＝450（万元）

无合同部分发生减值：

A原材料的可变现净值＝385.5－300×30％＝295.5（万元）

A原材料无合同部分的成本＝1 200×30％＝360（万元）

A原材料应计提的存货跌价准备金额＝（360－295.5）－0＝64.5（万元）

Y产成品的减值计算如下：

Y产成品的可变现净值＝650－88＝562（万元）

Y产成品的成本＝700（万元）

Y产品发生减值，其减值金额＝（700－562）－150＝－12（万元）

综上，甲公司2025年12月31日应计提的存货跌价准备金额＝64.5－12＝52.5（万元）