本题考查增值税的税率与征收率。

农机零部件不属于农机的范围，不适用9%的低税率，应按13%的税率征收增值税。

【选项A、B、D错误】杂志、天然气、二甲醚均适用9%的低税率。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查增值税的征税范围。

【选项A正确】货物期货（包括商品期货和贵金属期货），应当征收增值税。

【选项B正确】银行销售金银的业务，应当征收增值税。

【选项C正确】印刷图书、报纸、杂志，应当征收增值税。

【选项D错误】自然人销售自己使用过的物品，免征增值税。

【选项E正确】专门生产或销售货物（包括烧卤熟制食品在内）的个体工商户及其他个人应当征收增值税。

因此，本题正确答案为选项ABCE。

本题考查增值税的征税范围。

【选项D错误】水路运输的光租业务、航空运输的干租业务，属于经营租赁，即现代服务中的租赁服务。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查增值税的计税依据。

纳税人发生应税行为，如果价款和折扣额在同一张发票上分别注明的，以折扣后的价款为销售额征收增值税；如果将折扣额另开发票，不论其在财务上如何处理，均不得从销售额中减除折扣额。

依据题干数据，甲公司当月该笔业务应缴纳增值税=（90 000-9 000）×13%=税10 530（元）。

因此，本题正确答案为选项B。