对按照房产原值计算房产税的房产，无论会计上如何核算，房产原值均应包括地价，包括为取得土地使用权支付的价款、开发土地发生的成本费用等。宗地容积率低于0.5的，按照房产建筑面积的2倍计算土地面积并据此确定计入房产原值的地价。该企业宗地容积率＝1200÷3000＝0.4，低于0.5，计入房产原值的土地价款＝900×（1200×2÷3000）＝720（万元），该企业每年应缴纳的房产税＝（2000＋720）×（1－20%）×1.2%＝26.112（万元）。

采用以物易物方式进行商品交易签订的合同，应按合同所载的购销合计数作为计税依据。转让土地使用权和转让不动产应按产权转移书据进行贴花，该房地产开发公司应缴纳印花税＝（2000＋2500）×0.5‰＝2.25（万元）。

选项D，纳税人在依法办理土地、房屋权属登记前，权属转移合同、权属转移合同性质凭证不生效、无效、被撤销或者被解除的，纳税人可以向税务机关申请退还已缴纳的税款。