本题考查增值税应纳税额的计算。

一般纳税人按照规定不得抵扣且未抵扣进项税额的不动产，发生用途改变，用于允许抵扣进项税额项目的，按照下列公式在改变用途的次月计算可抵扣进项税额：可抵扣进项税额=增值税扣税凭证注明或计算的进项税额×不动产净值率。

依据题干数据，可抵扣进项税额=100×90%=90（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查个人所得税的征收管理。

纳税人在取得经营所得的次年3月31日前，向经营管理所在地主管税务机关办理汇算清缴。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查税收制度。

税额式减免是通过直接减少应纳税额的方式实现的减税免税，具体包括全部免征【选项A】、减半征收【选项B】、核定减免率【选项C】以及另定减征税额等。

【选项D、E错误】税基式减免是通过直接缩小计税依据的方式实现的减税免税，具体包括起征点、免征额、项目扣除以及跨期结转等。

因此，本题正确答案为选项ABC。

本题考查税务登记。

因此，本题正确答案为选项CDE。