选项A错误，生产用设备的折旧应登记制造费用，不影响损益。

选项C错误，即征即退的增值税应贷方登记其他收益科目。

选项D错误，收到的洪灾弥补损失，属于与过去相关的收益类政府补助，应直接冲减营业外支出。

企业确认的其他综合收益在未来其他权益工具投资出售时转入留存收益，未来产生纳税义务，故当期应确认递延所得税负债40万元 （160×25％），选项C正确。

企业当期收到政府补助应当确认为递延收益，但税法规定当期一次性全部纳入应纳税所得额，当期应当纳税调增，未来期间纳税调减，纳税义务减少，当期确认递延所得税资产400万元（1 600×25％），选项D正确。

当期税会差异事项中无永久性差异，当期所得税费用＝5 200×25％＝1 300（万元），选项A错误，选项E正确。

当期应交税费＝（5 200＋1 600）×25％＝1 700（万元），选项B错误。

A原材料的减值计算如下：

有合同部分：

W产成品的可变现净值＝1 120－65×70％＝1 074.5（万元）

W产成品的成本＝1 200×70％＋300×70％＝1 050（万元）

有合同部分未发生减值

无合同部分：

W产成品的可变现净值＝1 350×30％－65×30％＝385.5（万元）

W产成品的成本＝1 200×30％＋300×30％＝450（万元）

无合同部分发生减值：

A原材料的可变现净值＝385.5－300×30％＝295.5（万元）

A原材料无合同部分的成本＝1 200×30％＝360（万元）

A原材料应计提的存货跌价准备金额＝（360－295.5）－0＝64.5（万元）

Y产成品的减值计算如下：

Y产成品的可变现净值＝650－88＝562（万元）

Y产成品的成本＝700（万元）

Y产品发生减值，其减值金额＝（700－562）－150＝－12（万元）

综上，甲公司2025年12月31日应计提的存货跌价准备金额＝64.5－12＝52.5（万元）