电子支付的法律关系主体主要包括发端人、受益人、银行和认证机构。发端人和受益人可以理解为消费者和商家，因此，发端人与受益人之间是商务合同关系，选项A正确。认证机构在网上为参与电子商务各方提供各种认证要求、证书服务、确认用户关系，因此，认证机构与用户之间是认证服务合同关系，选项B、C错误。银行包括发端人银行、受益人银行和中间银行，与发端人、受益人之间是金融服务合同关系，选项D错误。