A牌卷烟的最低计税价格＝110×（1－30%）＝77（元/条），大于出厂价格65元/条，应按照最低计税价格计征消费税。77元/条＞70元/条，A牌卷烟属于甲类卷烟。该企业当期应纳消费税＝200×50000×0.003＋200×250×77×56%＝2186000（元）。

因纳税人违反规定需要追征税款的进出口货物，应适用违反规定的行为发生之日实施的税率；行为发生之日不能确定的，适用海关发现该行为之日实施的税率，选项B当选。

经临时批准入境的外国车船和香港特别行政区、澳门特别行政区、台湾地区的车船，不属于车船税的征收范围，不征收车船税，选项A当选。省、自治区、直辖市人民政府根据当地实际情况，可以对公共交通车船，农村居民拥有并主要在农村地区使用的摩托车、三轮汽车和低速载货汽车定期减征或者免征车船税，选项B、D不当选。捕捞渔船免征车船税，选项C不当选。

农业生产者销售的自产农产品，无论是否在零售环节，一律免征增值税，选项A当选。国产抗艾滋病病毒药品免征生产环节和流通环节增值税，流通环节包含零售环节，选项B当选。纳税人生产销售和批发、零售有机肥产品免征增值税，选项C当选。对从事农产品批发、零售的纳税人销售的部分鲜活肉蛋产品免征增值税，卤制鹌鹑蛋不属于鲜活肉蛋产品，在零售环节应当征收增值税，选项D不当选。