留购的租赁货物，以海关审定的留购价格为关税计税价格，选项A不当选。运往境外修理的货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，以境外修理费和料件费为基础审定计税价格，选项C不当选。易货贸易、寄售、捐赠、赠送等不存在成交价格的进口货物，由海关与纳税人进行价格磋商后，按照“进口货物海关估价方法”估定计税价格，5种估价方法应当依次使用，不能直接使用倒扣价格估价方法，选项D不当选。

在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受产权的单位和个人为契税的纳税人。特别注意契税的纳税人是承受方。本题中，出让国有土地使用权的自然资源局是出让方，不需要缴纳契税，选项A不当选。国家机关、事业单位、社会团体、军事单位承受土地、房屋权属用于办公、教学、医疗、科研和军事设施的，免征契税，选项B不当选。以自有房产作股投入本人独资经营的企业，不缴纳契税，选项C不当选。

纳税人通过自设非独立核算门市部销售的自产应税消费品，应当按照“门市部对外销售额或者销售数量”计算消费税，选项B不当选。

个人养老金如果选择在其他劳务报酬、稿酬、特许权使用费等所得或经营所得中扣除的，其缴费在次年汇算清缴时在限额标准内据实扣除，选项D不当选。