本题考查个人所得税的征收管理。

纳税人在取得经营所得的次年3月31日前，向经营管理所在地主管税务机关办理汇算清缴。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查烟叶税。

【选项A、B错误】烟叶税计税依据为纳税人收购烟叶实际支付的价款总额，包括纳税人支付给烟叶生产销售单位和个人的烟叶收购价款和价外补贴。价外补贴统一按烟叶收购价款的10%计算。依据题干数据，应纳税额=（88+88×10%）×20%=19.36（万元）。

【选项D错误】纳税人应当向烟叶收购地的主管税务机关申报缴纳烟叶税。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查增值税应纳税额的计算。

一般销售方式下的销售额是指纳税人发生应税交易取得的与之相关的价款，包括货币和非货币形式的经济利益对应的全部价款，不包括按照一般计税方法计算的销项税额和按照简易计税方法计算的应纳税额。

依据题干数据，甲公司当月该笔业务的增值税销项税额=（113 000+6 780）÷（1+13%）×13%=13 780（元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查部门预算编制。

【选项A、B错误】部门预算是编制政府预算的一种制度和方法，即由政府各部门依据国家有关法律法规及履行职能的需要编制，反映部门所有收入和支出情况的综合财政计划，它是政府各部门履行职能和事业发展的物质基础。

【选项C错误】部门预算的基本含义之一是财政预算要落实到每一个具体部门，预算管理以部门为依托。改变财政资金按性质归口管理的做法，财政将各类不同性质的财政资金统一编制到使用这些资金的部门。

因此，本题正确答案为选项D。