本题考查资源税。

【选项A错误】煤炭开采企业因安全生产需要抽采的煤成（层）气，免征资源税。

【选项D错误】稠油、高凝油减征40%资源税。

因此，本题正确答案为选项AD。

本题考查烟叶税。

【选项A正确】在中华人民共和国境内，依照《中华人民共和国烟草专卖法》规定收购烟叶的单位为烟叶税的纳税人。所以甲卷烟厂为烟叶税的纳税人。

【选项B错误】纳税人应当向烟叶收购地的主管税务机关申报缴纳烟叶税。

【选项C错误】烟叶税的纳税义务发生时间为纳税人收购烟叶的当日，即为4月5日。

【选项D错误】烟叶税的计税依据为纳税人收购烟叶实际支付的价款总额，包括纳税人支付给烟叶生产销售单位和个人的烟叶收购价款和价外补贴，其中，价外补贴统一按烟叶收购价款的10%计算。所以，甲卷烟厂应纳烟叶税税额=90×（1+10%）×20%=19.8（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查环境保护税。

应税水污染物按照污染物排放量折合的污染当量数确定其计税依据。环境保护税应纳税额的计算公式：应税水污染物的应纳税额=污染当量数×适用税额。

依据题干数据，汞及其化合物的污染当量数=50÷0.0001=500 000，该企业当月应纳税额=500 000×8÷10 000=400（万元）。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查环境保护税。

依据题干数据，污染当量数=该污染物的排放量÷该污染物的污染当量值=5 000÷0.025=200 000；

应缴纳的环境保护税=污染当量数×适用税额=200 000×4=800 000（元）

因此，本题正确答案为选项C。