购进农产品，从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。则甲公司当月购进该批农产品准予抵扣的进项税额＝10 000×9%＝900（元）。因此，选项B正确。

一般纳税人购进的贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务，其增值税进项税额不得从销项税额中抵扣。

题目所述内容正确。

增值税起征点仅适用于个人，且不适用于登记为一般纳税人的个体工商户，所以本题表述错误。