在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担（医保目录范围内的自付部分）累计超过15 000元的部分，由纳税人在办理年度汇算清缴时，在80 000元限额内据实扣除。

选项A、D，员工出差，食宿包干，差旅补助需要缴纳个人所得税；选项B，企业以现金形式发给个人的住房补贴、医疗补助费，应全额计入领取人的当期工资、薪金收入计征个人所得税。但对外籍个人以实报实销形式取得的住房补贴，暂免征收个人所得税；选项C，公司给员工人人有份的现金形式餐费补贴属于不得免税的福利费，应当并入职工的当月工资薪金收入计缴个人所得税。

拖船按照发动机功率每千瓦折合净吨位0.67吨，拖船按相同净吨位船舶税率的50%计征税款。该拖船应缴纳船舶吨税＝3 000×0.67×2.9×50%÷10 000＝0.29（万元）。

环境保护、节能节水项目的所得，自项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第1年至第3年免征企业所得税，第4年至第6年减半征收企业所得税。符合条件的环境保护、节能节水项目包括：公共污水处理、公共垃圾处理、沼气综合开发利用、节能减排技术改造、海水淡化等。选项C，不适用三免三减半优惠。