选项C，未开具发票或者未全额开具发票的，以交易双方签订的销售合同所载的售房金额及其他收益确认收入；

选项E，营改增后的收入，应该按照不含增值税金额作为转让房地产收入。

单位建筑面积成本费用＝清算时的扣除项目总金额÷清算的总建筑面积单位建筑面积成本费用＝3960÷（20000×90%）＝0.22（万元/平方米）；

扣除项目金额＝1000×0.22＝220（万元）；

增值额＝500－220＝280（万元）；

增值率＝280÷220×100%＝127.27% ；

土地增值税＝280×50%－220×15%＝107（万元）。

选项B，扣留建筑安装施工企业的质量保证金，只有开具发票的才可以扣除；未开具发票的，不得计算扣除。

选项C，货币安置拆迁的，房地产开发企业凭合法有效凭据计入拆迁补偿费。

选项D，房地产开发企业的预提费用、逾期开发土地闲置费不得扣除。