零基预算法的优点表现在：一是以零为起点编制预算（选项A不当选），不受历史期经济活动中的不合理因素影响（选项C不当选），能够灵活应对内外环境的变化，预算编制更贴近预算期企业经济活动需要；二是有助于增加预算编制透明度，有利于进行预算控制。其缺点主要体现在：一是预算编制工作量较大（选项D当选）、成本较高（选项B不当选）；二是预算编制的准确性受企业管理水平和相关数据标准准确性影响较大。

总制造费用=3000×（1-10%）+1000=3700（万元）。选项D当选。

现值指数法是净现值法的辅助方法，在各方案原始投资额现值相同时，实质上就是净现值法，因此利用净现值法和现值指数法进行投资项目可行性分析时得出的结论是一致的。