一般纳税人跨地区提供建筑服务，适用一般计税方法计税的，以取得的全部含税价款扣除支付的分包款后的余额，按照2%的预征率计算应预缴税款。该公司应预缴的增值税=（480-200）÷（1+9%）×2%=5.14（万元）。

在较低税负下，甲企业应选择享受小型微利企业税收优惠政策，即减按 25% 计算应纳税所得额，按 20% 的税率缴纳企业所得税。甲企业 2025 年一季度应预缴的企业所得税税额 =100×25%×20%=5（万元）。

自 2023 年 1 月 1 日起至 2027 年 12 月 31 日止，对物流企业自有（包括自用和出租）或承租的大宗商品仓储设施用地，减按所属土地等级适用税额标准的 50% 计征城镇土地使用税。所称大宗商品仓储设施，是指同一仓储设施占地面积在 6 000 平方米及以上，且主要储存粮食、棉花、油料、糖料、蔬菜、水果、肉类、水产品、化肥、农药、种子、饲料等农产品和农业生产资料，煤炭、焦炭、矿砂、非金属矿产品、原油、成品油、化工原料、木材、橡胶、纸浆及纸制品、钢材、水泥、有色金属、建材、塑料、纺织原料等矿产品和工业原材料的仓储设施。B 处仓储设施占地面积不足 6 000 平方米，不能享受优惠政策，应全额缴纳城镇土地使用税，选项 B、D 不当选。A 处仓储设施满足上述条件，可以享受减征优惠政策，选项 A 不当选，选项 C当选。

运往境外修理的机械器具、运输工具或其他货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，应当以境外修理费和料件费为基础确定计税价格，选项A当选。运往境外加工的货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，应当以境外加工费、料件费、复运进境的运输及相关费用、保险费为基础确定计税价格，选项B当选。关税征收管理可以实施货物放行与税额确定相分离的模式，选项C当选。纳税人、扣缴义务人缴纳税款确有困难或暂无缴纳能力的，海关应当中止税收强制执行，选项D当选。