选项A，房地产开发企业的发包工程未最终办理结算而未取得全额发票的，在证明材料充分的前提下，其发票不足金额可以预提，但最高不得超过合同总金额的10%。

选项A、B，直接用于农、林、牧、渔业的生产用地免征城镇土地使用税。农副产品加工厂占地和从事农、林、牧、渔业生产单位的生活、办公用地不包括在内。

选项C，对于各类危险品仓库、厂房所需的防火、防爆、防毒等安全防范用地，可由各省、自治区、直辖市税务局确定，暂免征收城镇土地使用税；对仓库库区、厂房本身用地，应依法征收城镇土地使用税。

选项B，如果代理人在缔约国另一方的活动仅限于准备性或辅助性范围（仓储、展览、采购及信息收集等活动），则不构成企业的非独立代理人（或常设机构）。

选项C、D，缔约国一方企业通过代理人在缔约国另一方进行营业时，如果该代理人是专门从事代理业务的，则不应因此视其代理的企业在缔约国另一方构成常设机构。这类专门从事代理业务的代理人一般称作独立代理人，其不仅为某一个企业代理业务，也为其他企业提供代理服务。

选项E，地方政府债券利息收入，属于免税收入。