耕地占用税、车辆购置税应计入有关资产成本，随存货销售结转扣除，或在以后各期采用折旧、摊销方式分期扣除，选项A、D不当选。企业所得税不得在税前扣除，选项C不当选。

设立前，原始权益人向项目公司划转基础设施资产相应取得项目公司股权的，适用特殊性税务处理，选项B不当选。转让REITs份额时，原始权益人通过二级市场认购（增持）该基础设施REITs份额，按照先进先出原则认定优先处置战略配售份额，选项C不当选。设立阶段，原始权益人向基础设施REITs转让项目公司股权实现的资产转让评估增值，当期可暂不缴纳企业所得税，递延至基础设施REITs完成募资并支付股权转让价款后纳税，选项D不当选。

留购的租赁货物，以海关审定的留购价格为关税计税价格，选项A不当选。运往境外修理的货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，以境外修理费和料件费为基础审定计税价格，选项C不当选。易货贸易、寄售、捐赠、赠送等不存在成交价格的进口货物，由海关与纳税人进行价格磋商后，按照“进口货物海关估价方法”估定计税价格，5种估价方法应当依次使用，不能直接使用倒扣价格估价方法，选项D不当选。

契税计税依据不包括增值税，税务机关核定的契税计税价格为不含增值税价格。选项C不当选。