耕地占用税、车辆购置税应计入有关资产成本，随存货销售结转扣除，或在以后各期采用折旧、摊销方式分期扣除，选项A、D不当选。企业所得税不得在税前扣除，选项C不当选。

设立前，原始权益人向项目公司划转基础设施资产相应取得项目公司股权的，适用特殊性税务处理，选项B不当选。转让REITs份额时，原始权益人通过二级市场认购（增持）该基础设施REITs份额，按照先进先出原则认定优先处置战略配售份额，选项C不当选。设立阶段，原始权益人向基础设施REITs转让项目公司股权实现的资产转让评估增值，当期可暂不缴纳企业所得税，递延至基础设施REITs完成募资并支付股权转让价款后纳税，选项D不当选。

对在征税范围内单独建造的地下建筑用地，暂按应征税款的50%征收城镇土地使用税。已取得地下土地使用权证的，按土地使用权证确认的土地面积计算应纳税额。购置该地下建筑，纳税人应自办理权属转移、变更登记手续，房地产权属登记机关签发房屋权属证书之次月起开始纳税，即从9月至12月，共4个月。该企业2024年应纳的城镇土地使用税＝500×12×50%×4÷12＝1000（元）。

水利工程占用耕地，减按每平方米2元的税额征收耕地占用税，选项A当选。军用码头占用耕地，免征耕地占用税，选项B不当选。农田水利设施占用耕地，不缴纳耕地占用税，选项C不当选。城区内机动车道占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税，选项D不当选。