有出口经营权的外贸企业购进应税消费品直接出口，适用消费税出口免税并退税政策，选项D当选。

留购的租赁货物，以海关审定的留购价格为关税计税价格，选项A不当选。运往境外修理的货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，以境外修理费和料件费为基础审定计税价格，选项C不当选。易货贸易、寄售、捐赠、赠送等不存在成交价格的进口货物，由海关与纳税人进行价格磋商后，按照“进口货物海关估价方法”估定计税价格，5种估价方法应当依次使用，不能直接使用倒扣价格估价方法，选项D不当选。

色度污染当量数＝污水排放量（吨）×色度超标倍数÷色度污染当量值＝1000×［（150－50）÷50］÷5＝1000×2÷5＝400。该化工厂当月应缴纳环境保护税＝400×3＝1200（元）。

罚款属于税务行政处罚行为，申请人对税务机关做出的税务行政处罚行为不服的，可以申请行政复议也可以直接向人民法院提起行政诉讼，选项A当选。