选项A，印刷企业接受出版单位委托，自行购买纸张，印刷有统一刊号（CN）以及采用国际标准书号编序的图书、报纸和杂志，按销售货物征收增值税。

选项B、C、D，属于不征收增值税的项目。

选项B，“保本收益、报酬、资金占用金、补偿金”，是指合同中明确承诺到期本金可全部收回的投资收益。金融商品持有期间（含到期）取得的非保本的上述收益，不属于利息或利息性质的收入，不征收增值税。

选项C，港口设施经营人收取的港口设施保安费，按照“港口码头服务”缴纳增值税。

选项D，纳税人已售票但客户逾期未消费取得的运输逾期票证收入，按照“交通运输服务”缴纳增值税。

选项A、B，水路运输的光租业务、航空运输的干租业务，属于“有形动产租赁服务”；水路运输的程租、期租业务，属于“交通运输服务”。

选项D，纳税人在游览场所经营索道、摆渡车、电瓶车、游船等取得的收入，按照“生产生活服务——文化体育服务”缴纳增值税。

选项D，纳税人取得的财政补贴收入，与其销售货物、服务、无形资产、不动产的收入或者数量直接挂钩的，应按规定计算缴纳增值税；纳税人取得的其他情形的财政补贴收入，不属于增值税应税收入，不征收增值税。

选项E，属于增值税法定免税项目。