本题考查增值税应纳税额的计算。

水路运输的程租、期租业务，属于交通运输服务中的水路运输服务，税率为9%；打捞属于现代服务，税率为6%。

依据题干数据，该公司6月应缴纳的增值税=1 090÷（1+9%）×9%+272.5÷（1+9%）×9%+173.31÷（1+6%）×6%-39=83.31（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查政府间事权的划分。

政府间的财政关系主要通过政府预算管理体制具体体现，它是正确处理各级政府之间的分配关系、确定各级预算收支范围和管理职权的一项根本制度。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查社会保障支出。

参加城乡居民基本养老保险的个人，年满60周岁、累计缴费满15年，且未领取国家规定的基本养老保障待遇的，可以按月领取城乡居民养老保险待遇。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查政府预算模式。

一般公共预算的支出重点主要集中于政权建设、事业发展、公共投资及分配调节四大领域。

（1）保证国家机构，如立法、司法、行政、国防、外交等执行社会管理职能部门，所需资金支出。【选项A】

（2）保证科学、文化、教育、卫生、体育等事业发展中必须由财政提供资金的部分需要的支出。【选项D】

（3）满足大型公共工程设施、公益性基础设施等非营利性工程项目的支出，如邮政、能源、交通、水利、气象、环保等方面。【选项C】

（4）具有收入分配调节功能的支出。【选项E】

因此，本题正确答案为选项ACDE。