本题考查增值税应纳税额的计算。

纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查增值税应纳税额的计算。

纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票（不含财政票据）上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：

桥、闸通行费可抵扣进项税额=桥、闸通行费发票上注明的金额÷（1+5%）×5%

依据题干数据，桥、闸通行费可抵扣进项税额=500÷（1＋5%）×5%＝23.81（元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查增值税的税率与征收率。

2027年12月31日前，对月销售额10万元以下（含本数）的增值税小规模纳税人，免征增值税。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查印花税。

【选项D错误】已缴纳印花税的应税凭证，变更后所列金额增加的，纳税人应当就增加部分的金额补缴印花税；变更后所列金额减少的，纳税人可以就减少部分的金额向税务机关申请退还或者抵缴印花税。

因此，本题正确答案为选项D。